BSDI versión 4.x tiene algunos errores relacionados con los subprocesos. Si se desea usar MySQL en esta versión, se debería instalar todos los parches relacionados con subprocesos. Al menos se debería instalar el parche M400-023.

En algunos sistemas BSDI versión 4.x, se pueden tener problemas con las bibliotecas compartidas. El síntoma es que no se pueden ejecutar programas cliente, por ejemplo, mysqladmin. En este caso, se necesitará reconfigurar con la opción --disable-shared para que no se usen bibliotecas compartidas.

Algunos clientes han tenido problemas con BSDI 4.0.1 donde el binario mysqld no puede abrir tablas pasado un tiempo. Es debido a algunos errores relacionados con el sistema y las bibliotecas que provocan que mysqld cambie el directorio actual sin habérselo solicitado.

La solución puede ser actualizar MySQL a la versión 3.23.34 o posterior o bien, después de ejecutar configure, quitar la línea #define HAVE_REALPATH del fichero config.h antes de ejecutar make.

Nótese que esto significa que en BSDI no se puede enlazar simbólicamente los directorios de una base de datos a otra base de datos o una tabla a otra base de datos. (Sí es posible establecer un vínculo simbólico a otro disco).