MySQL バージョン 3.23.6 より、3 種類の基本テーブル形式（ISAM、HEAP、MyISAM）を選択できるようになりました。これより新しい MySQL のバージョンでは、コンパイルの方法に応じて追加のテーブル型（InnoDB または BDB）をサポートしています。1 つのデータベースに異なる型のテーブルを収容することができます。

新しいテーブルを作成するときに、そのテーブルの型を MySQL に通知できます。通常、デフォルトのテーブル型は MyISAM です。

MySQL では、テーブル定義とカラム定義を保持する .frm ファイルが必ず作成されます。テーブルのインデックスとデータは、テーブル型に応じて、このファイル以外の 1 つ以上のファイルに格納されます。

コンパイルまたはアクティブ化されていないテーブル型を使用しようとすると、MySQL によってそのテーブル型の代わりに MyISAM 型のテーブルが作成されます。この動作は、さまざまなテーブル型をサポートする MySQL サーバ間でテーブルをコピーする場合に便利です（ほとんどの場合、マスタサーバは安全性を高めるためにトランザクションストレージエンジンをサポートし、スレーブサーバは処理速度を高めるために非トランザクションストレージエンジンのみをサポートしています）。

MySQL の初心者は、このテーブル型の自動変更に戸惑うかもしれません。この点については、バージョン 4.1 で新しいクライアント/サーバプロトコルに警告を導入し、テーブル型が自動変更される際に警告を生成する方法で対応する予定です。

ALTER TABLE ステートメントを使用すれば、テーブルを別の型に変換できます。 See 項6.5.4. 「ALTER TABLE 構文」。

MySQL では 2 種類のテーブルをサポートしていることに注意してください。1 つはトランザクションセーフのテーブル（InnoDB と BDB）、もう 1 つは非トランザクションセーフのテーブル（HEAP、ISAM、MERGE、MyISAM）です。

トランザクションセーフのテーブル（TST）には次の利点があります。

InnoDB テーブルを使用するには、少なくとも innodb_data_file_path 起動オプションを使用する必要があることに注意してください。 See 項7.5.3. 「InnoDB 起動オプション」。

非トランザクションセーフのテーブル（NTST）には次の利点があります。

同じステートメントで TST テーブルと NTST テーブルを組み合わせると、両方の利点を活かすことができます。