Puede ejecutar varios servidores en Windows iniciándolos manualmente desde la línea de comandos, cada uno con sus parámetros apropiados. En sistemas basados en Windows NT, tiene la opción de instalar varios servidores como servicios Windows y ejectuarlos de ese modo. Las instrucciones generales para ejecutar servidores MySQL desde la línea de comandos o como servicios se dan en Sección 2.3, “Instalar MySQL en Windows”.Esta sección describe cómo asegurarse que cada servidor arranca con distintos valores en las opciones de arranque que deban ser únicas para cada servidor, tales como el directorio de datos. Estas opciones se describen en Sección 5.11, “Ejecutar más de un servidor MySQL en la misma máquina”.